酸性pH值對反相色譜柱分離的影響主要表現在以下幾個方面：

1. 流動相的pH值可以影響化合物的電離狀態。當流動相的pH值低于化合物的pKa時，化合物會電離，增加其在流動相中的溶解度。而當流動相的pH值高于化合物的pKa時，化合物的質子化會增加其疏水性，使其在反相柱上的保留增強。
2. 酸性pH值會影響反相色譜柱上的選擇性配體的狀態，從而影響中性化合物的分離選擇性以及色譜峰的對稱性。

因此，在反相色譜過程中，可以通過調整流動相的pH值來優化分離效果。