在樣品前處理中，濾膜的選擇非常重要，主要需考慮材質和孔徑兩個方面。

1. 材質：根據所要過濾溶液的屬性選擇合適的濾膜材質。有機系濾膜適用于過濾有機相或有機相溶液，例如水溶液如果錯選了有機膜，可能會導致過濾流速極低或無法過濾。相反，水系濾膜只能過濾水溶液，如果用于過濾有機相溶液，濾膜會溶解，導致液相儀器和色譜柱受損。對于水/有機混合流動相的過濾，首選有機相濾膜。如果混合流動相中有機相的比例較小，可以先用有機溶劑（如甲醇或乙腈）潤濕濾膜再進行過濾。
2. 孔徑：根據實驗需求選擇孔徑大小合適的濾膜。一般情況下，常用的孔徑有0.22μm、0.45μm、0.8μm等，不同的孔徑對應不同的過濾精度。

在選擇濾膜時，還需要考慮其他因素，如耐壓性、流量、使用溫度等。此外，為了確保樣品的安全和準確度，需要定期檢查和更換濾膜。